当把CocoaPods生成的workspace移动到上层目录时，需要改下Pods.xcconfig和工程里的一些设置，就通常没什么难度。
当遇到这个问题时：
在Podfile文件里指定下工程目录就行了，比如我在Podfile文件添加这行就行了：
主要是让Pod找到子目录中的工程文件。
当在update或install时遇到这个问题：
只需要把当前Pod的目录清理一下就行了。在终端执行以下命令：
setup成功后执行install或update即可。
Could not automatically select an Xcode project
原文：http://www.cnblogs.com/Milo-CTO/p/4647907.html