一般web系统的目录结构如下，其中src下的包结构和webroot下（除meta-inf和web-inf）的文件夹可以根据自己的项目实际调整，但是javaee规范的大目录结构不会变：
META-INF:到底做什么用
META-INF, 说白了就是存放一些meta information相关的文件的这么一个文件夹。
一个典型的META-INF目录下可能包含如下几种文件或者子目录：
MANIFEST.MF
INDEX.LIST
x.SF
x.DSA
services/
但是，既然是目录，那么我们可以把文件放在其下，并在项目中引用到即可，不必要非得存放相应的文件到其中。所以完全可以把一些配置文件放到里面，然后指定读取的绝对路径地址即可。
javaee web项目结构图
maven项目目录结构
原文：http://www.cnblogs.com/brolanda/p/4244720.html