1 QC：逐条过滤，内存不大，如果是压缩文件取决于缓冲大小，一般设置1G；
2 SOAPAligner：比对需要读入reference，取决于reference大小，比较大的如人类hg19和细菌，设置15G左右；
3 SOAP denovo：组装软件，取决于数据量，大约设置为数据量的10倍，一般高通量数据一个sample以4G算的话，设置40G等；
4 velvet：组装软件，比SOAP denovo耗内存要多一些，在SOAP基础上按需增加，一般比Soapdenovo多设置50%；
5 预测，MetaGeneMark：内存消耗很小，1-2G足够；
原文：http://www.cnblogs.com/lyon2014/p/4022629.html