参考链接:.gitignored files are hidden from tree view regardless of setting
假如Atom打开的文件夹有.gitignore 文件，会隐藏在.gitignore 忽略的文件/文件夹，参考链接中的设定，
在File->Setting,在Setting,点击"Open config Folder",在打开的新窗口中，可以配置config.cson,
将config.cson中的:
"tree-view": hideVcsIgnoredFiles: true
改为
"tree-view": hideVcsIgnoredFiles: false
保存之后，.gitignore 忽略的文件/文件夹就显示出来了。
修改Atom 隐藏.gitignore忽略的文件/文件夹的配置
原文：http://www.cnblogs.com/fsong/p/5468447.html