FASTA文件的拆分：
（1）如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b：
awk -v RS=‘>‘ ‘NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print ">"$0}‘ a.fasta|sed ‘/^$/d‘>b.fasta
（2）将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中：
awk ‘/^>/{f=++d".fasta"} {print > f}‘ input.fasta
FASTA文件合并：
cat *.fasta > output.fasta
cat `ls -tr *.fasta` > output.fasta #按时间反序的顺序合并文件
原文：http://www.cnblogs.com/wq242424/p/5310585.html