1、若是使用安裝版的Beyond Compare，將安裝路徑加到環境變量，這樣就可以在cmd中執行BCompare.exe
2、在cmd的執行路徑下增加一個文件diff_to_html，輸入以下內容
text-report layout:side-by-side & options:ignore-unimportant,display-context & output-to:%3 output-options:html-color %1 %2
3、運行以下命令(若是使用綠色版Beyond Compare，可以直接把BCompare.exe圖標拖進cmd窗口內執行)
BCompare.exe /silent @diff_to_html file1.txt file2.txt report.html
/silent -> 不要消息提示，若想看執行結果的消息提示可以去掉這個參數
file1.txt -> 比較文件1
file2.txt -> 比較文件2
report.html -> 生成的diff結果
輸出的report.html會存放在cmd的執行目錄下。若要指定其他輸出路徑，將最後一參數帶上絕對路徑。
ps:目前只用在txt格式文件的比較，其餘文件類型的比較不知道是否可以執行成功。
原文：http://www.cnblogs.com/t09sunny/p/4799992.html